Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT4P19013 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT4P19013 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT4P19013 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT4P19013 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT4P19013 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT4P19013 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT4P19013 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT4P19013 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT4P19013 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT4P19013 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRT4P19013 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT4P19013 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT4P19013 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT4P19013 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT4P19013 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT4P19013 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT4P19013 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT4P19013 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT4P19013 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT4P19013 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRT4P19013 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRT4P19013 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT4P19013 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT4P19013 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT4P19013 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT4P19013 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT4P19013 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT4P19013 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT4P19013 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT4P19013 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT4P19013 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT4P19013 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT4P19013 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms