Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms