Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFTRP13569 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFTRP13569 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFTRP13569 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFTRP13569 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFTRP13569 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFTRP13569 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFTRP13569 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFTRP13569 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFTRP13569 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CFTRP13569 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFTRP13569 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFTRP13569 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFTRP13569 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFTRP13569 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFTRP13569 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFTRP13569 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CFTRP13569 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFTRP13569 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CFTRP13569 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFTRP13569 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFTRP13569 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFTRP13569 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFTRP13569 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFTRP13569 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC27.58■■■□□ 2
CFTRP13569 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFTRP13569 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms