Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms