Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX6A1P12074 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms