Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT3P12035 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT3P12035 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT3P12035 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT3P12035 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRT3P12035 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms