Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms