Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX4O95219 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX4O95219 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX4O95219 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms