Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK1O94907 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK1O94907 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK1O94907 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK1O94907 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK1O94907 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK1O94907 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK1O94907 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK1O94907 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK1O94907 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK1O94907 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms