Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSVO60911 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSVO60911 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSVO60911 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSVO60911 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSVO60911 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSVO60911 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSVO60911 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSVO60911 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSVO60911 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms