Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GMDSO60547 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GMDSO60547 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GMDSO60547 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GMDSO60547 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GMDSO60547 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GMDSO60547 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GMDSO60547 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GMDSO60547 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GMDSO60547 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms