Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO3O43524 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms