Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMC8O43402 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMC8O43402 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EMC8O43402 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMC8O43402 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMC8O43402 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMC8O43402 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMC8O43402 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMC8O43402 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EMC8O43402 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMC8O43402 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMC8O43402 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC8O43402 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC8O43402 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC8O43402 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMC8O43402 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms