Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBDO15205 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBDO15205 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms