Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD8O14715 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD8O14715 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD8O14715 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD8O14715 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD8O14715 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD8O14715 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD8O14715 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD8O14715 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD8O14715 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD8O14715 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms