Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms