Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F3O00716 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F3O00716 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F3O00716 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F3O00716 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F3O00716 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms