Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF26H0Y7S4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF26H0Y7S4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms