Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E9PBE3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E9PBE3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms