Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA6L4A6NEF3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA6L4A6NEF3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms