Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms