Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POMPQ9Y244 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms