Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM35Q9UPQ4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM35Q9UPQ4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM35Q9UPQ4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM35Q9UPQ4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms