Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP25Q9UHP3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP25Q9UHP3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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