Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms