Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms