Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DKK2Q9UBU2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms