Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms