Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCHIP1Q9P0W5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms