Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CENPMQ9NSP4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms