Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCC13Q9NSE7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCC13Q9NSE7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms