Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms