Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR1EQ9GZS1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms