Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP1Q9C000 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms