Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARD11Q9BXL7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARD11Q9BXL7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms