Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFT27Q9BW83 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT27Q9BW83 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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