Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms