Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms