Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FYCO1Q9BQS8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms