Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms