Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCT8L2Q96SF2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms