Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms