Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ1Q96JM4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms