Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG3Q96JB2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms