Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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