Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C18orf8Q96DM3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms