Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms