Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms