Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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RABGGTAQ92696 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RABGGTAQ92696 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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