Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3CQ92520 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms